朝天宮為南京市博物館所在地，是一座綜合性歷史藝術類博物館，是南京市市立博物館，國家重點博物館之一，是江蘇省、南京市愛國主義教育基地。其前身是建國初期成立的南京市文物保管委員會，1978年南京市博物館正式掛牌。 南京市博物館擔負著南京地區的地下遺址和古墓葬的考古發掘調查，文物的保護、藏品的徵集與保管，以豐富的文物、文獻資料及研究成果為基礎，展示南京在中國各個歷史發展階段的發展的軌跡，重點展示南京古都歷史文化的成就。 南京博物館建築體制基本上還是文廟和學宮的傳統建制；文廟前是運瀆，有高大的紅色垣牆環繞，宮牆外正面有“萬仞宮牆”四個楷書大字。從大成門北上丹墀，正面有石階三道，拾級而上，正中即是巍峨巨集麗的大成殿。殿內高大軒敞，原先供有“大成至聖先師之位”，現為《南京歷史文物陳列》。大成殿後是先賢殿，又名崇聖殿，原供有孔子門徒及歷代先賢牌位，殿廣七楹，是朝天宮建築中儲存比較完好的清代建築。由先賢殿往東，有花牆環繞，翠竹夾道；進園門迎面是飛雲閣，飛雲閣東側是八角攢頂的御碑亭，亭中立有乾隆皇帝四次來朝天宮所題詩的碑刻。由飛雲閣向西是敬一亭，這裡是治城的最高點。