牛首山有寺院肇始於南朝初年。唐朝貞觀時期，寺院規模巨集大，名為佛窟寺，為禪宗之前“牛頭禪”發祥地。北宋後易名巨集覺寺。南宋毀於戰亂，明代復興。時至1856年，寺院毀於洪楊之亂，香火中斷百年。 而重建後，徵得文化界知名人士和佛教界高僧建議，以供奉於牛首山地宮的佛頂舍利命名，取名佛頂寺。 佛頂寺為牛首山主要建築之一，佔地面積六十八畝，建築面積近四十畝，仿唐風格，傳統中軸線格局。共有殿堂七座，外圍有僧竂、齋堂等建築。 唐代建築規模巨集大，氣勢磅礴，形體俊美，莊重大方，整齊而不呆板，華美而不纖巧，舒展而不張揚，古樸卻富有活力，正是當時時代精神的完美體現。 而佛頂寺，更是繼承了這種風格。