總兵府又稱總鎮府,始建於明朝萬曆四年(公元1576年),后因大地震破壞,原貌大部分消失,現在的總兵府是重建的。總兵府作為歷史文化景點有三大特點:一是資源的稀缺性,它是全國唯一的海島總兵府。二是歷史文化的內涵豐富,明、清二朝300多年間,有 173位正、副總兵赴任,民族英雄如劉永福也曾任南澳總兵官,鄭成功曾在島上舉義旗,留下招兵樹。三是對台關係意義深遠,南澳總兵府自康熙二十四年起,負責閩粵二省及台灣、澎湖海防軍務,成為台灣是中國不可分割一部分的重要歷史見證。1999年,汪道涵先生上島考察工作時,欣然題字“閩粵總鎮府”。