梅爾克修道院最為壯觀的就是極盡奢華的梅爾克教堂。 巴洛克風格的教堂是整個修道院的最高點，以便於更好地聆聽上帝的旨意。 教堂內部金碧輝煌，天花板上繪滿了宗教故事。 教堂的藝術裝飾彙集了各領域最傑出的大師作品： Antonio Beduzzi（內部壁畫的設計、草圖）， Johann Michael Rottmayr（壁畫、祭壇畫）， Paul Troger（祭壇畫），Giuseppe Galli-Bibiena（佈道壇和祭壇設計）， Lorenzo Mattielli （雕塑設計）， Peter Widerin （雕塑）。