靈通山地質科普博物館內設有電子地理模型展區、科普演示展區和動物標本展區等功能區,主要利用了圖片、文字、解説、實物標本等形式,展示了地球演化歷史以及靈通山地質公園的地質景觀、地質發展史、生物多樣性、人文景觀和社會環境等。